在我们的日常生活中，我们所使用的录像机与我们所见到的PC设备有很大的相同点，都存在硬盘文件系统中，目前市场上，PC-basedDVR一般基于Windows系统，文件系统一般采用NTFS或FAT32；而嵌入式DVR所采用的文件系统则与厂商选择的嵌入式操作系统有密切的关系。目前嵌入式DVR中所采用的嵌入式操作系统有RTOS、pSOS、嵌入式Linux、vxWorks等，而采用的文件系统则有较多种类，如MS-DOS兼容文件系统、UNIX兼容文件系统、Windows兼容文件系统等。这就面临了许多兼容性的问题。

针对一些文件系统在数据存储领域上的不足，一些厂商专业团队开始研发出更加适合存储的文件系统，录像机从开始到结束为一个录像机段，录像机段长度可从几秒钟到几十小时，数据可从几K到几十T。采用这种硬盘管理方式，克服了FAT系统对长时间录像管理存在的缺陷。由于不存在分包录像，因此也不存在包与包之间丢帧现象；磁头不需要频繁读写数据与文件索引，延长硬盘使用寿命；硬盘录满后，采用逐帧覆盖技术，不存在硬盘碎片。可以将硬盘形象地比做一盘录像机带，硬盘任何地方的错误，不会影响前面或后面的录像。在突然断电的情况下，也能保存断电前瞬间的图像；同时，原始录像资料盘数据与PC不兼容，无法在PC上直接修改，保证原始资料的保密性和可靠性。

FAT文件存储方式虽然存在兼容问题，但是针对目前行业市场资金投入比例和开发难度的比较，还是会选择它。国内只有少数公司拥有该项技术可以解决兼容问题，从嵌入式DVR硬盘文件系统的发展方向看，长时间稳定录像采用这种方式可以大幅度提高硬盘录像机的可靠性，但需要专业公司具备开发硬盘操作系统的能力与经验。所以说，在这方面各个公司还是具有很大的竞争力的。